Manuela Marz

Erfolgreiche Bearbeitung der im Praktikum zu realisierenden Aufgaben.
Die Prüfung kann nur durch Wiederholen des ganzen Moduls wiederholt werden.

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221 B.Sc. Bioinformatik: Wahlpflichtmodul (Bioinformatik)

4 SWS Vorlesung/Praktikum

Die Studierenden sollen grundlegende bioinformatische Dateiformate (fasta, fastq, gff, gtf, gb, aln, stk, nexus, ...) und Programme aus den verschiedensten Anwendungsgebieten der Bioinformatik kennen lernen und mit deren Verwendung vertraut werden.
Im Rahmen der Veranstaltung werden Tools aus den Bereichen: Alignment, Annotation, Assemblierung, Phylogenie, Next Generation Sequencing, Mapping, Differentielle Genexpression, RNA Faltung und Metabolomik vorgestellt und deren Anwendung sowie Vor- und Nachteile analysiert und diskutiert.
Weiterhin werden die entsprechenden bioinformatischen Datenbanken und deren Verwendung betrachtet.
Die Studierenden sollen mit einem breiten Spektrum der aktuell in Wissenschaft und Wirtschaft verwendeten bioinformatischen Dateiformate, Programme und Datenbanken vertraut werden.

Die Studierenden sollen befähigt werden, grundlegende bioinformatische Programme nutzen zu können (web-basiert und lokal) und gängige bioinformatische Dateiformate kennen lernen.
Dabei beschäftigen wir uns u.a. mit
• Sequenzhomologieprogrammen,
• Alignmentprogrammen und Phylogenieprogrammen,
• bioinformatischen Datenbanken.

keine