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Name des Moduls [52690] Methoden der Hochdurchsatzsequenzierung - Praktikum Bezeichnung des Moduls FMI-BI0049

Studiengang [221] - Bioinformatik ECTS Punkte 4

Arbeitsaufwand für Selbststudium 30 Häufigkeit des Angebotes (Modulturnus) jedes 2. Semester (ab Sommersemester)
Arbeitsaufwand in Präsenzstunden 90 Dauer des Moduls 1
Arbeitsaufwand Summe (Workload) 120    

Modul-Verantwortliche/r

Manuela Marz

Voraussetzung für die Vergabe von Leistungspunkten (Prüfungsform)

Anfertigung eines Methoden-/Ergebnisprotokolls und Abschlussvortrag zum Praktikum.

Voraussetzung für die Zulassung zum Modul

Keine

Empfohlene bzw. erwartete Vorkenntnisse

Grundlegende Kenntnisse über die Verwendung von Linux sowie Shell-Funktionen zur Navigation und Dateimanipulation

FMI-BI0003 Einführung in die Bioinformatik I
FMI-BI0004 Einführung in die Bioinformatik II
FMI-BI0026 Einführung in die Genetik

Art des Moduls (Pflicht-, Wahlpflicht- oder Wahlmodul)

- 221 B.Sc. Bioinformatik: Wahlpflichtmodul (Bioinformatik)
- 221 M.Sc. Bioinformatik: Wahlpflichtmodul (Bioinformatik)

Zusammensetzung des Moduls / Lehrformen (V, Ü, S, Praktikum, …)

6 SWS Praktikum

Inhalte

Die Studierenden sollen aktuelle Methoden der Hochdurchsatzverfahren kennenlernen (MicroArrays, Deep Sequencing von Genomen und Transkriptomen). Standardisierte Assemblierungs- und Mappingmethoden werden neben allgemeinen Auswertungsstrategien (Statistische Evaluation, Genomannotation) vorgestellt. Typische biologische Fragestellungen und aktuelle Probleme werden analysiert und diskutiert.
Im Praktikum werden die Studierenden die in der Vorlesung erlernten Fähigkeiten anwenden und gleichzeitig am aktuellen Stand der Forschung mitwirken.

Lern- und Qualifikationsziele

- Grundlegendes Verstandnis von molekularbiologischen Fragestellungen
- Methoden der Hochdurchsatzverfahren
- Bewusstsein uber Vor-/Nachteile der verschiedenen Assemblierungs- und Mappingmethoden
- Umgang mit mehreren Terrabyte von Daten
- Auswertung und Analyse von Hochdurchsatzdaten

Voraussetzung für die Zulassung zur Modulprüfung

Keine

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