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Name des Moduls [52350] Metabolische und regulatorische Netzwerke Bezeichnung des Moduls FMI-BI0015

Studiengang [221] - Bioinformatik ECTS Punkte 7

Arbeitsaufwand für Selbststudium 135 Häufigkeit des Angebotes (Modulturnus) jedes 2. Semester (ab Sommersemester)
Arbeitsaufwand in Präsenzstunden 75 Dauer des Moduls 2
Arbeitsaufwand Summe (Workload) 210    

Modul-Verantwortliche/r

Stefan Schuster

Voraussetzung für die Vergabe von Leistungspunkten (Prüfungsform)

Modulprüfung (100%) (Klausur oder mündliche Prüfung (60 %), Protokolle zum Praktikum (40 %))

Empfohlene Literatur

R. Heinrich, S. Schuster: The Regulation of Cellular Systems, Chapman & Hall 1996.

Zur Vorlesung wird außerdem ein Skript zur Verfügung gestellt

Voraussetzung für die Zulassung zum Modul

keine

Empfohlene bzw. erwartete Vorkenntnisse

B.Sc. Bioinformatik,
FMI-BI0006 (Mathematische Biologie I)

Art des Moduls (Pflicht-, Wahlpflicht- oder Wahlmodul)

221 M.Sc. Bioinformatik: Wahlpflichtmodul (Bioinformatik)

992 M.Sc. Chemische Biologie: Wahlpflichtmodul

Zusammensetzung des Moduls / Lehrformen (V, Ü, S, Praktikum, …)

2 SWS Vorlesung
1 SWS Übung
2 SWS Praktikum

Inhalte

Enzymkinetik, Bilanzgleichungen, Netzwerkanalyse (einschließlich Erhaltungsrelationen und Elementarmoden), Dynamische Modellierung von metabolischen und regulatorischen Netzwerken, Metabolische Kontrollanalyse, Modellierung von Enzymkaskaden, Ultrasensitivität, Bistabilität, Grundlagen der Modellierung der Signaltransduktion, Calcium-Oszillationen

Lern- und Qualifikationsziele

Erwerb theoretischer Kenntnisse über die mathematische Modellierung metabolischer und (intrazellulärer) regulatorischer Netzwerke, Kennenlernen der Anwendungsmöglichkeiten der linearen Algebra, konvexen Analysis und von Differentialgleichungen für diese Modellierung.

In der Übung: Analytisches Lösen von Übungsaufgaben zum Stoffgebiet der Vorlesung.

Im Praktikum: Vertraut werden mit einschlägigen Programmen zur Simulation metabolischer und regulatorischer Netzwerke. Numerische Lösung von Übungsaufgaben zum Stoffgebiet der Vorlesung mittels dieser Programme.

Voraussetzung für die Zulassung zur Modulprüfung

keine

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