Friedrich-Schiller-Universität Jena

Name des Moduls	[52320] Analyse der Genexpression	Bezeichnung des Moduls	FMI-BI0012

Studiengang	[221] - Bioinformatik	ECTS Punkte	3

Arbeitsaufwand für Selbststudium	60	Häufigkeit des Angebotes (Modulturnus)	jedes 2. Semester (ab Sommersemester)
Arbeitsaufwand in Präsenzstunden	30	Dauer des Moduls	1
Arbeitsaufwand Summe (Workload)	90

Modul-Verantwortliche/r	Manja Marz
Voraussetzung für die Vergabe von Leistungspunkten (Prüfungsform)	Klausur oder mündliche Prüfung
Empfohlene Literatur	Helen Causton, Alvis Brazma, John Quackenbush; Microarray Gene Expression Data Analysis: A Beginner's Guide; 2003, Blackwell
Voraussetzung für die Zulassung zum Modul	keine
Empfohlene bzw. erwartete Vorkenntnisse	FMI-BI0003 (Einführung in die Bioinformatik I) FMI-BI0004 (Einführung in die Bioinformatik II) FMI-BI0026 Einführung in die Genetik FMI-BI0048 Skriptsprachen und ihre Anwendungen
Art des Moduls (Pflicht-, Wahlpflicht- oder Wahlmodul)	- 221 B.Sc. Bioinformatik: Wahlpflichtmodul (Bioinformatik) - 221 M.Sc. Bioinformatik: Wahlpflichtmodul (Bioinformatik)
Zusammensetzung des Moduls / Lehrformen (V, Ü, S, Praktikum, …)	2 SWS Vorlesung
Inhalte	• Übersicht über Technologien zur Genexpressionsanalyse • Laborbesuche um Geräte kennen zu lernen, Methoden zur Datenvorbehandlung (Messfehlermodelle und Normalisierung) für Microrarrays und RNASequenzierung • Praktische Anwendung Datenvorbehandlung (Praktika am Rechner), Differentielle Genexpression • Erkenntnisgewinn aus differentieller Expression, unüberwachtes Lernen (Clusteranalyse) • Rekonstruktion genregulatorischer Netzwerke • Datenbanken für die Genexpressionsanalyse • ethische und rechtliche Fragen
Lern- und Qualifikationsziele	• Grundverständnis der Technologien für Genexpresionsanalyse • Fähigkeit Datenvorbehandlung für Microarrays und RNASequenzierung selbstständig durchzuführen, • Fähigkeit zur kritischen Interpretation von Zwischen-und Endergebnissen • Einblick in Methoden der Wissensextraktion aus Messdaten, • Einblick in Shell und R Programmierung
Voraussetzung für die Zulassung zur Modulprüfung	keine